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        好氧反硝化菌種的復(fù)蘇培育剖析

        返回列表 來源:未知 發(fā)布日期:2019-08-06 10:24【

        藤黃球菌( Micrococcus luteus) 所分泌的復(fù)蘇促進(jìn)因子( resuscitation-promoting factor,Rpf) 的發(fā) 現(xiàn)被認(rèn)為是復(fù)蘇培養(yǎng) VBNC 狀態(tài)菌最重要的突 破。Rpf 在皮摩爾濃度下即可使自身處于 VBNC 狀態(tài)的細(xì)胞復(fù)活,并使可培養(yǎng)數(shù)量增長至 100 倍 以上,且可促進(jìn)細(xì)胞的生長。研究發(fā)現(xiàn)制藥廢 水中對(duì) Rpf 敏感的 VBNC 優(yōu)勢(shì)菌群主要有革蘭氏 陽 性 ( G+ ) 菌 如 Microbacterium、Gordonia 和 Leucobacter 屬 等,及 革 蘭 氏 陰 性 ( G- ) 菌 如 Candidimonas、Xanthobacter 和 Aminobacter 屬 等。



        1 材料與方法

        1. 1 實(shí)驗(yàn)材料

        高氨氮廢水取自浙江省金華市某工業(yè)污水處 理廠,其 COD 為 500 mg /L,NH+ 4-N 為 420 mg /L, NO- 2-N 未檢出,NO- 3-N 為 10 mg /L,pH 值為 7. 2。 1. 2 儀器 紫外分光光度計(jì)( UV-7504,上海欣茂儀器有限公司) ; 恒溫培養(yǎng)振蕩器( ZHWY-100C 上海智 誠儀 器 分 析 制 造 公 司) ; 臺(tái) 式 離 心 機(jī) ( 5417R, Eppendorf) ; 恒溫恒濕培養(yǎng)箱( HWS-350,寧波海 曙塞富實(shí)驗(yàn)儀器廠) ; 電子天平( JY3002,上海精密科學(xué)儀器有限公司 ) ; 移 液 槍 ( P500, Eppendorf) ; 電熱鼓風(fēng)干燥箱( DHG-9070A,上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司) 。



        2 實(shí)驗(yàn)方法

        2. 1 Rpf 蛋白純化


        將 M. luteus 的 rpf 基因克隆在 Escherichia coli BL21 ( DE3) 中誘導(dǎo)表達(dá),經(jīng)純化后獲得 Rpf 蛋白。 具體步驟簡述如下: 將 質(zhì) 粒 轉(zhuǎn) 化 的 Escherichia coli BL21( DE3) 接種至含有 50 mg /L 相應(yīng)抗生素的 LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃,120 r/min 培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長期,然后再接種至 200 mL SOB 培 養(yǎng)基中擴(kuò)大培養(yǎng),確認(rèn)轉(zhuǎn)化細(xì)菌濃度為 OD600 = 0. 6 時(shí),加入 IPTG 誘導(dǎo)劑至終濃度為 1 mmol /L, 20 ℃,120 r/min 誘導(dǎo)過夜。 離心( 12 000 r/min,10 min) 收集細(xì)胞,加入 緩沖液重懸菌體,并超聲破碎使得蛋白釋放出來。 經(jīng) Ni 柱吸附,100 mmol /L 的咪銼洗脫液洗脫后, 再利用純化試劑盒對(duì)目的蛋白進(jìn)行純化。提純的 Rpf 蛋白經(jīng) 0. 22 μL 微孔濾膜過濾后,加甘油至終 濃度為 50%,置于-20 ℃ 保存?zhèn)溆?。同時(shí),將 Rpf 蛋白高壓滅活( 121 ℃,20 min) 用于對(duì)照組的實(shí) 驗(yàn)研究。



        2. 2 Rpf 蛋白對(duì)

        VBNC 菌的復(fù)蘇促進(jìn)作用 MPN 培養(yǎng)體系中,吸取 1 mL 采自于污水處 理廠的高氨氮廢水加入至 9 mL LB 液體培養(yǎng)基 中,而后依次稀釋,連續(xù)設(shè)置 10 個(gè)稀釋梯度,每一個(gè)梯度設(shè)立 3 個(gè)平行。在各處理組稀釋液均 添加 0. 25% Rpf 蛋 白,對(duì)照組各稀釋 液添加 0. 25%無活 性 Rpf 蛋 白 上 清 液,將 樣 品 放 置 在 30 ℃ ,120 r/min培養(yǎng)體系中生長。通過測(cè)定處理 組與對(duì)照組培養(yǎng)液菌體密度( OD600 ) 來反映 Rpf 對(duì)菌體生長狀況的影響。同時(shí)記錄樣品的濁度以 獲得 MPN 值,利用 MPN 表計(jì)算出每個(gè)樣品中可 培養(yǎng)細(xì)菌的總數(shù)。 當(dāng)細(xì)菌總數(shù)處于穩(wěn)定,將處理組與對(duì)照組培 養(yǎng)液最大稀釋度分別涂布于固體平板中獲得可培 養(yǎng)細(xì)菌。對(duì)比兩組涂布平板的菌落差異,僅存在 于處理組的菌株則為對(duì) Rpf 蛋白敏感的 VBNC 菌。將純化后的的菌株擴(kuò)大培養(yǎng)并收集至 10% 的甘油中,-80 ℃ 保存。每種稀釋度的剩余培養(yǎng) 液則放至-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/span>



        3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

        基因經(jīng)克隆,并在 Escherichia coli BL21 ( DE3) 中誘導(dǎo)表達(dá)及系列純化后,獲得 Rpf 重組蛋白。結(jié)果如圖 1 所示,由 SDS-PAGE 圖可 知,蛋白洗脫液中含有清晰的目的條帶,重組蛋白 的分子量約為 23 kDa,且雜條帶數(shù)量相較于粗體 液明顯減少,說明經(jīng) Ni 柱洗脫后得到了純度較高 的 Rpf 蛋白。 本研究中所獲的重組蛋白的分子量相對(duì)于 Mukamolova 等從藤黃球菌上清液中分離提取的 Rpf 蛋白( 16~17 kDa) 偏大,其原因?yàn)榇酥亟M蛋白 未去除 N 端的 6 個(gè) His 標(biāo)簽。同時(shí),與 Mukamolova 等所獲的重組蛋白分子量( 25 kDa) 相當(dāng)。每隔 24 h 記錄 MPN 培養(yǎng)體系中處理組和對(duì) 照組在 600 nm 處的光密度值。當(dāng)數(shù)值趨于穩(wěn)定 后,讀取 MPN 值。在培養(yǎng)體系中,處理組最后 3 個(gè)稀釋度分別有 3 個(gè),3 個(gè)和 2 個(gè)渾濁管,對(duì)照組 分別有 3 個(gè),3 個(gè)和 1 個(gè)渾濁管,透明管意味著其 OD600值接近于 0。在各稀釋度中,處理組的菌體 生長量均大于對(duì)照組,尤其是在最后的稀釋度中,這表明 Rpf 可促進(jìn)細(xì)菌的生長。



        4 結(jié)論

        1) 本研究表明高氨氮廢水中存在大量對(duì) Rpf 敏感的 VBNC 細(xì)菌,其數(shù)量占總菌數(shù)的 58. 1%。 并分離純化 4 株 VBNC 菌株,其中 ZYR51 歸屬于 Gordonia 屬,菌 株 CHZYN52、CHZYR61 和 CHZYR63 均歸屬于 Pseudomonas 屬。

        2) 本研究表明 Pseudomonas 和 Gordonia 屬可 能為高氨氮廢水中存在的主要 VBNC 功能菌群, 經(jīng) Rpf 復(fù)蘇后具有較好的好氧反硝化性能。

        3) 本研究揭示在高氨氮廢水中,與藤黃球菌 具有較好親緣關(guān)系的 Gordonia 屬菌株 ZYR51 的 脫氮性能最強(qiáng)。從而為挖掘高效好氧反硝化菌提 供新的思路。




         

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